クローン病は、原因のはっきりしない炎症によって、消化管全体にびらんや潰瘍があらわれる疾患で、潰瘍性大腸炎などとともに炎症性腸疾患に分類されています。症状は腹痛、下痢、血便などを慢性的に繰り返し、症状が強く表れる活動期（再燃期）と症状の治まった寛解期を繰り返す点などは潰瘍性大腸炎とよく似ています。しかし、クローン病の場合、口から肛門までのどこにでも炎症が起こる可能性があること、炎症が連続的ではなく飛び飛びに起こることなどが異なっています。またクローン病は潰瘍が深くなりやすく、膿が腸とその他の組織の間にトンネルを作ってしまう瘻孔や穿孔ができやすいなどの特徴があります。
比較的若い世代に多い疾患で、原因ははっきりと解明されておらず、根治する治療法もまだ開発されていないことから、国の難病に指定されています。
なお、近年では炎症を抑えるための新しいメカニズムで作用する薬剤などが開発され、症状の無い寛解期を長く続けて、発病以前の日常生活に近い状態で暮らしていくことができるようになっています。

クローン病は口から肛門まで、消化管のどこにでも発症する可能性があります。そのため、症状は発症部位によって異なります。しかし、その中でも好発部位としては、小腸の大腸に近い部分や大腸の小腸に近い部部となっていますので、お腹の症状が中心となります。
主な症状としては、腹痛、下痢、血便で、その他には発熱、全身の倦怠感、腹部の腫瘤、出血による貧血、体重減少などがあらわれることがあります。
さらに、合併症を起こすことも多く、腸管から膿が漏れ出して、他の臓器との間でトンネルを作ってしまう瘻孔、膿瘍などの他、腸閉塞を起こすこともあり、肛門では痔ろうや裂肛などを起こすこともあります。
また、消化管以外の部位に症状があらわれることもあり、アフタ性口内炎など口腔症状、眼の症状として虹彩炎、骨の症状として関節炎などを起こすこともあります。
摂取する食物によって症状が憎悪することもありますので、その場合、入院して栄養療法を行うケースもあります。
摂取する食物によって症状が憎悪することもありますので、その場合、入院して栄養療法を行うケースもあります。